Instytut Sztuki PAN prowadzi ożywioną wymianę naukową z instytucjami o podobnym profilu badań, muzeami oraz fundacjami w wielu krajach w Europie i na świecie. W ramach współpracy naukowej z zagranicą prowadzone są badania archiwalne i kwerendy oraz badania porównawcze dotyczące wzajemnych relacji kulturalnych i artystycznych. Instytut Sztuki jest członkiem RIHA (www.riha-institutes.org), międzynarodowej instytucji skupiającej instytuty badawcze zajmujące się działalnością naukową w obszarze historii sztuki

Do placówek, z którymi Instytut współpracuje należą (w kolejności nazw krajów):

• Chorwacja: Chorwacka Akademia Nauk i Sztuk (Hrvatska akademija znanosti i umjetnosti), Zagrzeb, Sekcja Historii Muzyki Chorwackiej (Odsjek za povijest hrvatske glazbe Odsjek za povijest hrvatske glazbe)
• Czechy: Czeska Akademia Nauk (Akademie věd České republiky, Praga, Instytut Historii Sztuki (Ústav dějin umění AV ČR)
• Estonia: Estońska Akademia Nauk (Eesti Kunstiakademia), Tallin
• Francja: Narodowy Instytut Sztuki (Institut national d'histoire de l'art), Paryż
• Izrael: Instytut Historii Sztuki Uniwersytetu Hebrajskiego (Department of Art History, Hebrew University), Jerozolima
• Litwa: Instytut Historii Sztuki Akademii Sztuk Pięknych (Dailėtyros institutas, Vilniaus dailės akademija) Wilno
• Łotwa: Instytut Literatury, Folkloru i Sztuki Uniwersytetu Łotewskiego (Litreraturas, folkloras un makslas instituts Latvijas Universitate), Ryga
• Niemcy: Instytut Historii i Kultury Europy Środkowo-Wschodniej (Geistewissenchaftliches Zentrum Geschichte und Kultur Ostmitteleuropas), Lipsk; Instytut Herdera (Herder-Institut), Marburg
• Rosja: Państwowy Instytut Nauk o Sztuce, Rosja (Gosudarstwiennyj Instytut Iskusstwoznanija), Moskwa
• Słowacja: Słowacka Akademia Nauk – Instytut Muzykologii (Slovenska Akadémie Vied - Ústav hudobnej vedy).
• Słowacja: Uniwersytet Komeńskiego w Bratysławie – Instytut Muzykologii (Univerzita Komenského v Bratislave - Ústav hudobnej vedy)
• Słowenia: Instytut Historii Sztuki Franceta Steleta Słoweńskiej Akademii Nauk i Sztuk (Znanstvenoraziskovalni Center Slovenske Akademije Znanosti i Umetnosti, Umetnostnozgodovinski Institut Franceta Steleta), Ljublana
• Słowenia: Słoweńska Akademia Nauk i Sztuk – Instytut Muzykologii (Slovenske Akademije Znanosti in Umetnosti - Muzikološki Inštitut)
• Stany Zjednoczone: Uniwersytet Harvarda (Harvard University)
• Szwajcaria: Szwajcarski Instytut Sztuki (Schweizerisches Institut für Kunstwissenschaft), Zurich
• Szwecja: Międzynarodowe Muzeum Sztuki Nowoczesnej (International Art Moderna Museet), Sztokholm
• Ukraina: Instytut Teorii i Historii Architektury i Planowania Miast (Derżawnyj naukowo-doslidnyj institut teorii, historii architektury i mistobudowannja), Kijów; Muzeum Okręgowe w Winnicy
• Węgry: Instytut Historii sztuki Węgierskiej Akademii Nauk (Magyar Tudomanyos Akademia Muveszettorteneti Kutato Intezet), Budapeszt
• Wielka Brytania: British Academy, Londyn; Birkbeck College, Londyn; The Robert Anderson Research Charitable Trust, Londyn